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蛋白質體學實驗之膠體染色與影像分析
主要染色法比色
染色法 |
敏感度 |
操作繁雜度 |
質譜分析前樣品處理 |
影像掃瞄 |
再現性 |
Coomassie Stain |
8~28ng |
簡單 |
一般方法 |
一般光源 |
佳 |
Silver Stain |
0.6~1.2ng |
繁瑣 |
特殊方法 |
一般光源 |
不佳 |
SYPRO Ruby Stain |
1~10ng |
簡單 |
一般方法 |
雷射光源或紫外光源 |
佳 |
A. SYPRO Ruby染色法
●固定:以7%醋酸和10%甲醇浸泡凝膠
●三十分鐘後倒掉
●加入二次去離子水清洗一次
●加入SYPRO Ruby染色至16小時
●退染:再以7%醋酸和10%甲醇授泡凝膠
●三十分鐘後倒掉
●再加入二次去離子水清洗一次
由於SYPRO Ruby會與玻璃反應,為了避免SYPRO Ruby與儀器上的玻璃反應所以一定要將凝膠表面之SYPRO Ruby洗去。
★實驗操作所需之手套,可參考使用本站: 橡膠檢診手套或NBR手套
★實驗操作所需之血清試藥瓶,可參考使用本站: BOECO廣口血清試藥瓶
B. Coomassie Stain膠片染色法:
●取染色盤,倒入 CBR 染色液,放入膠片到染色缸中。
●在 CBR 中染色約 30 min,染色盤要加密蓋,置於旋轉平台慢速 50 rpm 搖盪
●染色後小心把 CBR 染劑倒回原來瓶中,整塊膠片變成藍色,先用自來水洗掉殘餘的染色液,再倒入約 20 mL 脫色液,加密蓋後再放回旋轉平台搖盪
●待脫色液轉成藍色後,可以換新脫色液;如此脫色數次,在一小時內應可看到蛋白質的藍色色帶出現。
●用過的脫色液,請回收倒在有機溶液的廢液桶中。
●待膠片背景完全透明後,染色脫色完成。倒去脫色液,改用 50% 甲醇液洗一兩次
★實驗操作所需之手套,可參考使用本站: 橡膠檢診手套或NBR手套
★實驗操作所需之血清試藥瓶,可參考使用本站: 廣口血清試藥瓶
★實驗操作所需之旋轉平台,可參考使用本站: OSR205 蹺蹺板式震盪器 或 RS-101 Rocking shaker搖擺振盪器/蹺蹺板震盪器
取出凝膠,上影像系統掃描或照膠系統拍照
★照膠所需之照像系統,可參考使用本站: UVCI 140/200萬畫素CCD凝膠照像系統
二維蛋白質影像樣點相對定量分析
★蛋白質定量所需之分析軟體,可參考使用本站: 二維電泳影像分析軟體(經濟版) Prodigy samespots 2D 或 二維電泳影像分析軟體 Progenesis samespots 2D
挖取影像比對後有變異的點
質譜前處理~膠內水解
參考來源:
Ribowsone蛋白質體學實驗教材、國立台灣大學生物技術研究中心/生物技術核心實驗
如需 二維膠體蛋白質體學實驗服務 ,歡迎來電或email: sales@cae.url.tw洽詢